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定量蛋白组学分析

定量蛋白组学分析

基于PRM的靶向蛋白质定量分析
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  与常见的大规模的蛋白质组学研究策略不同,靶向蛋白质组学技术是针对选中的目标蛋白或肽段进行监测和定量,被认为是“质谱领域的WB”。三重四级杆(QQQ)类型仪器上实现的SRM技术是质谱领域定量研究的金标准,Nature Methods杂志将其评为“Method of the Year 2012”。
基于SWATH的定量蛋白质组学分析
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(1)背景介绍  经典的定量蛋白质组学分析流程(如上述的iTRAQ,双甲基化,SILAC等)所采用的质谱扫描模式为DDA(又称Shotgun,鸟枪法)。SWATH是一种全新的全景式质谱扫描模式,该模式在扫描过程中将样品中所有的肽段分成若干个窗口,并对每个窗口中的所有肽段进行碎裂,采集二级质谱图,数据分析时通过靶向提取的分析方式,即可对不同样品中蛋白进行相对定量分析。SWATH模式克服了DDA模式中
基于标记的定量蛋白质组学分析
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  蛋白质是基因表达产物,在生物体内直接行使功能,因此研究其在各种刺激条件下的变化,为疾病发生等生理过程提供了重要线索。随着质谱技术发展,高通量蛋白质定量分析日臻完善,一轮实验周期往往可获取数千种蛋白的定量信息。
非标记定量蛋白质组学分析
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  定量蛋白质组学是蛋白质组学最重要的应用之一。定量的策略包括标记定量和非标记定量两大类。非标记定量对实验过程的操作和质谱仪的状态要求较高,但以其操作简便、试剂价格低廉等优势,同样受到很多人的关注。
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蛋白质组学